MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	T	7	7	30	36	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011255	ATT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011255	ATT	4	12	59	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011255	CAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011255	TAG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011255	CTACAA	2	12	144	155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011255	AGC	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011255	TA	3	6	329	334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011255	A	6	6	341	346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011255	GCT	2	6	364	369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011255	TGC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011255	A	7	7	432	438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011255	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011255	ATT	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011255	GAT	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011255	ATTTA	2	10	570	579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011255	AC	3	6	594	599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011255	CTTTTT	2	12	640	651	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011255	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011255	TTAC	2	8	716	723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011255	A	6	6	734	739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011255	TCTA	2	8	745	752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011255	GAT	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011255	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011255	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011255	TCTA	2	8	911	918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011255	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011255	TTC	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011255	TTA	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011255	TCA	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011255	T	7	7	1190	1196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011255	T	6	6	1212	1217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011255	TC	3	6	1244	1249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011255	CTT	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011255	CAT	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011255	TTC	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011255	ATA	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011255	TCT	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011255	TCA	3	9	1374	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011255	ATA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011255	CTCA	2	8	1400	1407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011255	AAG	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011255	TCT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011255	TAA	2	6	2012	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011255	GT	3	6	2067	2072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011255	ATA	2	6	2076	2081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011255	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011255	ATT	2	6	2145	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011255	A	7	7	2162	2168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011255	AC	3	6	2186	2191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011255	TTAC	2	8	2201	2208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011255	CAT	3	9	2210	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011255	CTC	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011255	TATT	2	8	2274	2281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011255	A	7	7	2286	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011255	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011255	TA	3	6	2311	2316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011255	A	6	6	2335	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011255	ACT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011255	AT	3	6	2376	2381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011255	TAT	2	6	2388	2393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011255	GTAA	2	8	2476	2483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011255	TTA	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011255	T	6	6	2568	2573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011255	AAAC	2	8	2576	2583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011255	A	6	6	2608	2613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011255	A	7	7	2634	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011255	ATTT	2	8	2643	2650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011255	TAC	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011255	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011255	T	6	6	2734	2739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011255	TTA	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011255	T	7	7	2797	2803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011255	CAT	2	6	2832	2837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011255	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011255	ATCA	2	8	2994	3001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011255	AG	3	6	3046	3051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011255	TTACAT	2	12	3063	3074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011255	AT	4	8	3073	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011255	TTA	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011255	TTC	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011255	GCA	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011255	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011255	AAT	2	6	3200	3205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011255	CTA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011255	A	6	6	3279	3284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011255	TACA	2	8	3296	3303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011255	TAA	2	6	3346	3351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011255	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011255	TAC	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011255	ATACT	2	10	3373	3382	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011255	A	7	7	4532	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011255	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011255	TAT	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011255	AT	3	6	4599	4604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011255	ACTA	2	8	4605	4612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011255	ATTA	2	8	4621	4628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011255	TC	3	6	4666	4671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011255	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011255	TCC	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011255	CCT	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011255	TCTT	2	8	4870	4877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011255	TCTT	2	8	4897	4904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011255	CAA	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011255	GCA	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011255	TCT	2	6	4984	4989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011255	AT	3	6	5012	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011255	CAT	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011255	AACA	2	8	5097	5104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011255	TCTT	2	8	5116	5123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011255	ATC	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011255	ACT	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011255	CTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011255	TAA	2	6	5202	5207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011255	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011255	CAC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011255	TGC	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011255	CTTA	2	8	5322	5329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011255	TACCT	2	10	5349	5358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011255	T	7	7	5462	5468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011255	CTC	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011255	C	6	6	5602	5607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_011255	ATC	3	9	5627	5635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011255	TCATTC	2	12	5649	5660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011255	CT	5	10	5667	5676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011255	CT	3	6	5679	5684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011255	CTA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011255	TC	3	6	5711	5716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011255	TTC	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011255	T	6	6	5738	5743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011255	CTTT	2	8	5744	5751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011255	TTAT	2	8	5769	5776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011255	TA	3	6	5799	5804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011255	AATAC	2	10	5824	5833	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011255	A	8	8	5841	5848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011255	CT	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011255	TAA	2	6	5872	5877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011255	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011255	AATATA	2	12	5911	5922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011255	ATTA	2	8	5934	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011255	TTC	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011255	TC	3	6	5973	5978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011255	TTAT	2	8	5987	5994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011255	TCT	2	6	6051	6056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011255	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011255	TA	3	6	6068	6073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011255	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011255	A	6	6	6181	6186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011255	ATT	2	6	6200	6205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011255	A	8	8	6216	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011255	A	6	6	6237	6242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011255	A	9	9	6247	6255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011255	ATT	2	6	7012	7017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011255	ATA	2	6	7020	7025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_011255	A	6	6	13687	13692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_011255	TAAA	2	8	13806	13813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011255	ATA	5	15	13830	13844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_011255	AAT	2	6	13845	13850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_011255	AAAG	2	8	14102	14109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_011255	TAT	2	6	14509	14514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_011255	AT	3	6	21247	21252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_011255	AT	3	6	21264	21269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_011255	T	7	7	21297	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_011255	ATT	2	6	21312	21317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_011255	AATT	2	8	21341	21348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011255	T	7	7	21369	21375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_011255	T	6	6	21786	21791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011255	TTA	2	6	21879	21884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011255	CTT	2	6	21913	21918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_011255	TAAA	2	8	22117	22124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011255	CTTT	2	8	22521	22528	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_011255	ATTTT	2	10	22534	22543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011255	T	8	8	22551	22558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_011255	AT	3	6	23139	23144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_011255	ATT	3	9	23175	23183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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